Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Vmn2r-ps25-201ENSMUST00000202322 2321 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmigd1Q9D7L8 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms