Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syce1Q9D495 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syce1Q9D495 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syce1Q9D495 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Syce1Q9D495 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syce1Q9D495 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syce1Q9D495 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syce1Q9D495 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syce1Q9D495 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syce1Q9D495 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syce1Q9D495 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syce1Q9D495 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syce1Q9D495 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syce1Q9D495 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syce1Q9D495 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syce1Q9D495 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syce1Q9D495 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syce1Q9D495 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syce1Q9D495 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syce1Q9D495 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Syce1Q9D495 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syce1Q9D495 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syce1Q9D495 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syce1Q9D495 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syce1Q9D495 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syce1Q9D495 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Syce1Q9D495 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syce1Q9D495 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syce1Q9D495 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syce1Q9D495 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syce1Q9D495 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Syce1Q9D495 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syce1Q9D495 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syce1Q9D495 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syce1Q9D495 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Syce1Q9D495 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syce1Q9D495 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syce1Q9D495 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Syce1Q9D495 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syce1Q9D495 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syce1Q9D495 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Syce1Q9D495 Gm807-202ENSMUST00000224929 408 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Syce1Q9D495 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syce1Q9D495 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Syce1Q9D495 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syce1Q9D495 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syce1Q9D495 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syce1Q9D495 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syce1Q9D495 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Syce1Q9D495 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Syce1Q9D495 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syce1Q9D495 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Syce1Q9D495 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syce1Q9D495 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syce1Q9D495 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syce1Q9D495 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syce1Q9D495 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syce1Q9D495 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Syce1Q9D495 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syce1Q9D495 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syce1Q9D495 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syce1Q9D495 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syce1Q9D495 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syce1Q9D495 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syce1Q9D495 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Syce1Q9D495 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Syce1Q9D495 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syce1Q9D495 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syce1Q9D495 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syce1Q9D495 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syce1Q9D495 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syce1Q9D495 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syce1Q9D495 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syce1Q9D495 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Syce1Q9D495 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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