Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem53Q9D0Z3 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem53Q9D0Z3 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem53Q9D0Z3 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem53Q9D0Z3 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem53Q9D0Z3 Emp1-201ENSMUST00000032330 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem53Q9D0Z3 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem53Q9D0Z3 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Tmem53Q9D0Z3 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Olfr1415-202ENSMUST00000204009 2815 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Trmt44-201ENSMUST00000030980 3790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Kcnh3-201ENSMUST00000041415 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Tbc1d24-209ENSMUST00000201301 4261 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Tmem53Q9D0Z3 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms