Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Nfya-201ENSMUST00000046719 3645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Celf3-215ENSMUST00000200342 3173 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Erlin2-201ENSMUST00000033873 4838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Gm13126-201ENSMUST00000117079 3063 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Ctnnb1-214ENSMUST00000178812 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Ptbp1-206ENSMUST00000165704 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 4833418N02Rik-201ENSMUST00000137539 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Gal3st2-201ENSMUST00000094663 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Cd300lg-202ENSMUST00000107163 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Neu2-206ENSMUST00000166259 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Nicn1Q9CQM0 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms