Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ncam1-203ENSMUST00000192584 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lbr-201ENSMUST00000005003 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Pdzk1ip1Q9CQH0 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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