Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Pkp2Q9CQ73 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Wdr92-201ENSMUST00000046955 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Ces1d-201ENSMUST00000034172 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Pkp2Q9CQ73 Odf2l-201ENSMUST00000029920 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Pkp2Q9CQ73 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Pkp2Q9CQ73 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 CT009536.2-201ENSMUST00000225370 665 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Pkp2Q9CQ73 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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