Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Commd4Q9CQ02 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Spata31d1a-203ENSMUST00000224982 5325 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Faim2-201ENSMUST00000023750 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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Commd4Q9CQ02 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 C230066G23Rik-201ENSMUST00000150195 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Abl2-202ENSMUST00000166172 10151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Commd4Q9CQ02 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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