Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH0

Ankrd17, Ankyrin repeat domain-containing protein 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd17Q99NH0 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
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Ankrd17Q99NH0 Taar7b-201ENSMUST00000092658 1077 ntAPPRIS P1 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ankrd17Q99NH0 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ankrd17Q99NH0 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ankrd17Q99NH0 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ankrd17Q99NH0 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ankrd17Q99NH0 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ankrd17Q99NH0 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ankrd17Q99NH0 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
Ankrd17Q99NH0 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.9
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Ankrd17Q99NH0 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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Ankrd17Q99NH0 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ankrd17Q99NH0 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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Ankrd17Q99NH0 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ankrd17Q99NH0 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ankrd17Q99NH0 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ankrd17Q99NH0 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
Ankrd17Q99NH0 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.44□□□□□ -0.9
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Ankrd17Q99NH0 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
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Ankrd17Q99NH0 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ankrd17Q99NH0 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ankrd17Q99NH0 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ankrd17Q99NH0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
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Ankrd17Q99NH0 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ankrd17Q99NH0 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ankrd17Q99NH0 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ankrd17Q99NH0 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ankrd17Q99NH0 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ankrd17Q99NH0 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ankrd17Q99NH0 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ankrd17Q99NH0 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ankrd17Q99NH0 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Ankrd17Q99NH0 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ankrd17Q99NH0 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC9.43□□□□□ -0.9
Ankrd17Q99NH0 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ankrd17Q99NH0 1700109G14Rik-202ENSMUST00000188538 754 ntTSL 3 BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ankrd17Q99NH0 Ccdc114-205ENSMUST00000211367 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
Ankrd17Q99NH0 4930431F10Rik-201ENSMUST00000213122 1157 ntTSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.9
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