Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Gm29101-201ENSMUST00000188329 1471 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Igsf11-202ENSMUST00000114706 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Gm35963-201ENSMUST00000211762 1425 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Gm3945-201ENSMUST00000196637 683 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Gm5191-201ENSMUST00000222882 1236 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Rasgrp1-204ENSMUST00000173252 1750 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Pxmp4-202ENSMUST00000109703 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Gm15702-201ENSMUST00000119680 444 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
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PtprtQ99M80 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Gm15020-201ENSMUST00000147142 636 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Fbxo16-201ENSMUST00000169656 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Rpl15-ps2-201ENSMUST00000184247 613 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 1700069L16Rik-201ENSMUST00000047891 537 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Gm5424-201ENSMUST00000053865 1240 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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PtprtQ99M80 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Mtcp1-202ENSMUST00000114081 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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PtprtQ99M80 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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PtprtQ99M80 Hamp2-203ENSMUST00000217812 437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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PtprtQ99M80 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Nmrk2-201ENSMUST00000005069 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Oprk1-201ENSMUST00000027038 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PtprtQ99M80 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.2 ms