Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Thsd4-206ENSMUST00000171654 8522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Ripor1-201ENSMUST00000043531 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Cnga4-201ENSMUST00000033187 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Idua-202ENSMUST00000112563 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Ttc17-203ENSMUST00000111237 4409 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Scnn1b-201ENSMUST00000033161 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Htr2c-202ENSMUST00000096299 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Gmip-202ENSMUST00000123453 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Megf11-202ENSMUST00000093829 3652 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Slc1a2-204ENSMUST00000111213 2093 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Sgk3-203ENSMUST00000168907 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Nmd3Q99L48 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms