Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Ubxn4Q8VCH8 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Camsap3-209ENSMUST00000207970 3817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Loxl3-201ENSMUST00000000707 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Ubxn4Q8VCH8 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
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