Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 Alms1-ps1-201ENSMUST00000159498 2166 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 Dleu2-212ENSMUST00000183079 535 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 4933440M02Rik-202ENSMUST00000205794 1601 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Csnka2ipQ8CH19 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Ly6e-210ENSMUST00000188866 2068 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Gm13461-201ENSMUST00000120980 662 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Neu2-201ENSMUST00000070898 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Csnka2ipQ8CH19 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms