Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Nrg1-211ENSMUST00000208497 2096 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Mia-202ENSMUST00000121848 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Dgkh-202ENSMUST00000226342 15261 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Gripap1-202ENSMUST00000101694 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ercc8Q8CFD5 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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