Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Kalrn-209ENSMUST00000114963 3207 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Aldoa-203ENSMUST00000106348 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Htatsf1Q8BGC0 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms