Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Gm2345-201ENSMUST00000193451 589 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Ptges3l-201ENSMUST00000093933 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Tnnt3-214ENSMUST00000105953 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Gm16069-201ENSMUST00000131146 545 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Gm37723-201ENSMUST00000194480 565 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NischQ80TM9 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Prr16-201ENSMUST00000116639 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Tbc1d21-201ENSMUST00000040217 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Cdip1-202ENSMUST00000117713 1964 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Gm20443-201ENSMUST00000173840 735 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 1700112K13Rik-201ENSMUST00000141892 701 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Mir6387-201ENSMUST00000184042 108 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NischQ80TM9 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
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