Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Hmgn2-201ENSMUST00000100472 881 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Hyal1-203ENSMUST00000123005 843 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm29431-201ENSMUST00000189848 449 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Naca-201ENSMUST00000073868 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Aamdc-207ENSMUST00000138060 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Mphosph10-201ENSMUST00000032735 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Ifitm1-202ENSMUST00000106040 560 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Ifitm1-203ENSMUST00000106042 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Pet100-201ENSMUST00000156380 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Ifitm1-201ENSMUST00000026564 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Try5-201ENSMUST00000064324 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Smap1-202ENSMUST00000129254 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Prrc2bQ7TPM1 BC048403-201ENSMUST00000065600 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Prrc2bQ7TPM1 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81 ms