Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Sirt5-201ENSMUST00000066804 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ssx9Q6XAS3 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Ssx9Q6XAS3 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ssx9Q6XAS3 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms