Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Nmrk1-203ENSMUST00000159572 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Nras-201ENSMUST00000029445 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vstm2lQ6PDS0 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms