Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Zbtb40Q6PCS8 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Zbtb40Q6PCS8 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Ift22-205ENSMUST00000200157 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Zbtb40Q6PCS8 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Zbtb40Q6PCS8 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Zbtb40Q6PCS8 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Zbtb40Q6PCS8 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Zbtb40Q6PCS8 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Zbtb40Q6PCS8 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Zbtb40Q6PCS8 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
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Zbtb40Q6PCS8 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
Zbtb40Q6PCS8 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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Zbtb40Q6PCS8 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zbtb40Q6PCS8 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zbtb40Q6PCS8 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zbtb40Q6PCS8 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zbtb40Q6PCS8 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Zbtb40Q6PCS8 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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Zbtb40Q6PCS8 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zbtb40Q6PCS8 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zbtb40Q6PCS8 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zbtb40Q6PCS8 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zbtb40Q6PCS8 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zbtb40Q6PCS8 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zbtb40Q6PCS8 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zbtb40Q6PCS8 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zbtb40Q6PCS8 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zbtb40Q6PCS8 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zbtb40Q6PCS8 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zbtb40Q6PCS8 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zbtb40Q6PCS8 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zbtb40Q6PCS8 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Zbtb40Q6PCS8 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zbtb40Q6PCS8 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zbtb40Q6PCS8 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zbtb40Q6PCS8 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zbtb40Q6PCS8 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zbtb40Q6PCS8 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Zbtb40Q6PCS8 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Zbtb40Q6PCS8 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Zbtb40Q6PCS8 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC14.44□□□□□ -0.1
Zbtb40Q6PCS8 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1219.3 ms