Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Ablim1-211ENSMUST00000111555 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Phf24-203ENSMUST00000107976 6538 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
CltbQ6IRU5 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Fam25c-201ENSMUST00000052126 408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
CltbQ6IRU5 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms