Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 2210406O10Rik-203ENSMUST00000149687 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Gm13267-202ENSMUST00000150099 281 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 4930447C11Rik-201ENSMUST00000204503 928 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Dedd-202ENSMUST00000097467 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Usp2-208ENSMUST00000177054 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Impdh2-ps-201ENSMUST00000120826 1545 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Gm15287-201ENSMUST00000132564 751 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Gm29135-201ENSMUST00000188411 612 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Gm3642-201ENSMUST00000166895 1762 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Srp14-202ENSMUST00000110862 587 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Gm5944-201ENSMUST00000118182 1001 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Gm15486-201ENSMUST00000135147 604 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Gm18733-202ENSMUST00000174447 401 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Gm20694-201ENSMUST00000176943 404 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Gm18001-201ENSMUST00000212023 688 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Gm45875-201ENSMUST00000212178 781 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Iah1-201ENSMUST00000076813 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Smarca2Q6DIC0 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Smarca2Q6DIC0 AC166361.2-201ENSMUST00000219269 1415 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Smarca2Q6DIC0 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smarca2Q6DIC0 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smarca2Q6DIC0 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smarca2Q6DIC0 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smarca2Q6DIC0 Gm26875-201ENSMUST00000181006 950 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Smarca2Q6DIC0 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Smarca2Q6DIC0 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smarca2Q6DIC0 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smarca2Q6DIC0 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smarca2Q6DIC0 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smarca2Q6DIC0 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smarca2Q6DIC0 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smarca2Q6DIC0 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smarca2Q6DIC0 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smarca2Q6DIC0 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Smarca2Q6DIC0 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarca2Q6DIC0 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarca2Q6DIC0 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarca2Q6DIC0 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarca2Q6DIC0 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarca2Q6DIC0 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarca2Q6DIC0 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Smarca2Q6DIC0 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 157.4 ms