Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFV6

Fndc3c1, Fibronectin type III domain containing protein 3C1, mousemouse

Predictions only

Length 1,356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3c1Q6DFV6 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Fndc3c1Q6DFV6 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Fndc3c1Q6DFV6 Gm2594-201ENSMUST00000214774 742 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Fndc3c1Q6DFV6 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Gm38344-201ENSMUST00000195306 1353 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Fndc3c1Q6DFV6 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Fndc3c1Q6DFV6 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Fndc3c1Q6DFV6 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Fndc3c1Q6DFV6 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Fndc3c1Q6DFV6 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Gm23255-201ENSMUST00000102244 110 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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Fndc3c1Q6DFV6 Scgb2b7-201ENSMUST00000178258 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Gm45469-201ENSMUST00000210468 854 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Mir326-201ENSMUST00000083637 95 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Fndc3c1Q6DFV6 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms