Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

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Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Osgin1-201ENSMUST00000098365 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Ocln-201ENSMUST00000022140 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Zfp568-201ENSMUST00000074322 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Ctnna3Q65CL1 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm15610-201ENSMUST00000120584 195 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 AC153929.1-201ENSMUST00000219009 303 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ctnna3Q65CL1 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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