Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Zfp810-201ENSMUST00000086278 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Fam107b-202ENSMUST00000115052 861 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
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Ccdc18Q640L5 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
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Ccdc18Q640L5 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 AC134601.2-201ENSMUST00000221071 130 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Olfr60-201ENSMUST00000075470 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Acyp1-201ENSMUST00000008966 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Ccdc18Q640L5 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Ccdc18Q640L5 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Ccdc18Q640L5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Ccdc18Q640L5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Ccdc18Q640L5 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Ccdc18Q640L5 1700011M02Rik-201ENSMUST00000113602 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Ccdc18Q640L5 Mocs2-201ENSMUST00000015680 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Ccdc18Q640L5 Gm23284-201ENSMUST00000178069 119 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
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Ccdc18Q640L5 n-R5s117-201ENSMUST00000179431 119 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 Gm25212-201ENSMUST00000179432 119 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 n-R5s138-201ENSMUST00000179476 119 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 n-R5s122-201ENSMUST00000179500 119 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Ccdc18Q640L5 n-R5s143-201ENSMUST00000179542 119 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
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