Protein–RNA interactions for Protein: Q61398

Pcolce, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, mousemouse

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Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcolceQ61398 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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PcolceQ61398 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Scmh1-201ENSMUST00000000087 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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PcolceQ61398 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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PcolceQ61398 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Rpl41-206ENSMUST00000177163 544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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PcolceQ61398 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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PcolceQ61398 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
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PcolceQ61398 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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PcolceQ61398 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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PcolceQ61398 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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PcolceQ61398 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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PcolceQ61398 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PcolceQ61398 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms