Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
BcanQ61361 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
BcanQ61361 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
BcanQ61361 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BcanQ61361 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BcanQ61361 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BcanQ61361 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BcanQ61361 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BcanQ61361 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BcanQ61361 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Adap2os-201ENSMUST00000140556 984 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
BcanQ61361 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
BcanQ61361 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms