Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Cln3Q61124 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Cln3Q61124 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Cln3Q61124 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Cln3Q61124 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Cln3Q61124 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
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Cln3Q61124 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Vamp1-203ENSMUST00000100942 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Lcp2-202ENSMUST00000109329 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Cln3Q61124 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Cln3Q61124 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Cln3Q61124 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Cln3Q61124 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Cln3Q61124 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cln3Q61124 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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