Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm16066-201ENSMUST00000118575 1086 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 1110028F11Rik-201ENSMUST00000137077 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Bckdk-201ENSMUST00000071056 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Dnajc12-201ENSMUST00000043317 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Asic5-201ENSMUST00000029641 1657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Nhlrc3-201ENSMUST00000056749 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Csnk2a1Q60737 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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