Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Atg4c-203ENSMUST00000180278 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 BC030500-201ENSMUST00000062978 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Gm2238-201ENSMUST00000192074 3669 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Ylpm1-202ENSMUST00000101202 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Gm15200-201ENSMUST00000149950 410 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Gm16285-201ENSMUST00000162999 347 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Gm8920-201ENSMUST00000196153 924 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Gm44038-201ENSMUST00000203952 889 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 AC153932.1-201ENSMUST00000218558 787 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Pate4-201ENSMUST00000034610 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Olfr1260-201ENSMUST00000061830 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Gm20541-201ENSMUST00000173035 1406 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Papss1-201ENSMUST00000029666 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Gm28359-201ENSMUST00000187470 1322 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Gm16440-201ENSMUST00000100900 1089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Gm21103-201ENSMUST00000112737 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
PtprnQ60673 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms