Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Aebp1-202ENSMUST00000109829 2541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 5730460C07Rik-201ENSMUST00000081193 1834 ntTSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Prss57-201ENSMUST00000020573 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Nop16-201ENSMUST00000026987 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Myo18a-224ENSMUST00000172303 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 1700016D06Rik-201ENSMUST00000033906 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Plxna4os1-201ENSMUST00000150314 1977 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Mitf-201ENSMUST00000043628 1921 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 1810053B23Rik-205ENSMUST00000188056 1592 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm26516-201ENSMUST00000180943 1397 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gm2606-201ENSMUST00000100754 1002 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms