Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Gm37852-201ENSMUST00000193027 350 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 BC049762-202ENSMUST00000065950 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Mapk8ip3-204ENSMUST00000117509 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Prdx2-208ENSMUST00000164807 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm30978-201ENSMUST00000211581 1066 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 AI463170-202ENSMUST00000218453 558 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm3755-201ENSMUST00000169555 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm6189-201ENSMUST00000164487 2082 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm12681-201ENSMUST00000132337 700 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm23675-201ENSMUST00000157311 125 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Mrpl30-207ENSMUST00000195373 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Fam208bQ5DTT3 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms