Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Tm2d3-201ENSMUST00000032726 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Gm43112-201ENSMUST00000196665 3122 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Pnpla6-201ENSMUST00000004681 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Pamr1-201ENSMUST00000028612 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Dlgap4-203ENSMUST00000099145 3402 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Syt7-202ENSMUST00000076968 6624 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
Fam220aQ3ZN08 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam220aQ3ZN08 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam220aQ3ZN08 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam220aQ3ZN08 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam220aQ3ZN08 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam220aQ3ZN08 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam220aQ3ZN08 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam220aQ3ZN08 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam220aQ3ZN08 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam220aQ3ZN08 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam220aQ3ZN08 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam220aQ3ZN08 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam220aQ3ZN08 AC122463.1-201ENSMUST00000214559 597 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam220aQ3ZN08 Colca2-202ENSMUST00000215038 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam220aQ3ZN08 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam220aQ3ZN08 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam220aQ3ZN08 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam220aQ3ZN08 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam220aQ3ZN08 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam220aQ3ZN08 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam220aQ3ZN08 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam220aQ3ZN08 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam220aQ3ZN08 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam220aQ3ZN08 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam220aQ3ZN08 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam220aQ3ZN08 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam220aQ3ZN08 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam220aQ3ZN08 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam220aQ3ZN08 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam220aQ3ZN08 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam220aQ3ZN08 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam220aQ3ZN08 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam220aQ3ZN08 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam220aQ3ZN08 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam220aQ3ZN08 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam220aQ3ZN08 Dok4-204ENSMUST00000212810 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam220aQ3ZN08 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam220aQ3ZN08 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam220aQ3ZN08 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam220aQ3ZN08 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam220aQ3ZN08 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam220aQ3ZN08 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam220aQ3ZN08 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam220aQ3ZN08 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam220aQ3ZN08 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Fam220aQ3ZN08 BC035947-201ENSMUST00000170511 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms