Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR0

Shisa3, Protein shisa-3 homolog, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa3Q3UPR0 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 1700011I03Rik-201ENSMUST00000079738 1013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Rpa3-201ENSMUST00000012627 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Vmn1r-ps144-201ENSMUST00000177291 939 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Gm16617-201ENSMUST00000181008 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Gm7439-201ENSMUST00000214053 835 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Ica1-204ENSMUST00000115520 1876 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Shisa3Q3UPR0 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms