Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULP7

Ctsll3, Cathepsin L-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctsll3Q3ULP7 Rps10-ps1-201ENSMUST00000074353 495 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Gm10334-201ENSMUST00000095999 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Tmem39a-204ENSMUST00000163884 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Gm15784-201ENSMUST00000120260 1462 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Gm13351-201ENSMUST00000118087 414 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 A930036K24Rik-201ENSMUST00000194146 1200 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Rnf133-202ENSMUST00000115354 1333 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Mog-201ENSMUST00000102665 1704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Gm12247-201ENSMUST00000117585 670 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ctsll3Q3ULP7 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms