Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Rtp4-202ENSMUST00000209422 1859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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Snx27Q3UHD6 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Gm11831-201ENSMUST00000141538 629 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Snx27Q3UHD6 Lyplal1-201ENSMUST00000045388 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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