Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYJ2

Prr27, 4930432K09Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr27Q3SYJ2 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Fads1-201ENSMUST00000010807 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Mtmr12-202ENSMUST00000071993 3351 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Abca2-201ENSMUST00000102919 8033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Fam186a-202ENSMUST00000100209 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Sez6l-205ENSMUST00000212480 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Rpl35a-204ENSMUST00000115078 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Gm33056-201ENSMUST00000213234 1120 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Prr27Q3SYJ2 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.3 ms