Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Hmgcs2-202ENSMUST00000120541 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Nras-208ENSMUST00000200069 831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm31401-201ENSMUST00000207352 734 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Olfr1212-201ENSMUST00000055895 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Tcf4-240ENSMUST00000201781 2779 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Osgin1-206ENSMUST00000152420 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm11660-201ENSMUST00000120955 412 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Treml4Q3LRV9 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms