Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Gas5-224ENSMUST00000162558 502 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 H2-Bl-203ENSMUST00000183999 358 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 2310057N15Rik-201ENSMUST00000054223 1028 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 n-R5s185-201ENSMUST00000083953 119 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Samd11Q1RNF8 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Tomm5-202ENSMUST00000107808 679 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Cdk5rap1-202ENSMUST00000109730 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 4930502E09Rik-201ENSMUST00000126016 755 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Ndufb5-204ENSMUST00000127477 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Spata18-203ENSMUST00000113548 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Cisd3-203ENSMUST00000107585 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Samd11Q1RNF8 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms