Protein–RNA interactions for Protein: Q149F1

Rpusd2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd2Q149F1 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Rpusd2Q149F1 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Odf3-201ENSMUST00000026555 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 AC163296.2-201ENSMUST00000220177 1315 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Wdcp-205ENSMUST00000220215 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC13.77□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Rpusd2Q149F1 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Rpusd2Q149F1 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Rpusd2Q149F1 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Olfr838-ps1-201ENSMUST00000211872 977 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Abhd14b-207ENSMUST00000213179 1627 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Vrk1-204ENSMUST00000220629 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rpusd2Q149F1 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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