Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm26047-201ENSMUST00000157308 113 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Tspo2-205ENSMUST00000162481 473 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Tmprss4-201ENSMUST00000034599 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rundc1Q0VDN7 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms