Protein–RNA interactions for Protein: Q08091

Cnn1, Calponin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnn1Q08091 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC9.65□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Alox12-201ENSMUST00000000329 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Cnn1Q08091 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Cnn1Q08091 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
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Cnn1Q08091 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Cnn1Q08091 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms