Protein–RNA interactions for Protein: Q07456

Ambp, Protein AMBP, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmbpQ07456 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Gramd1b-213ENSMUST00000211853 2659 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Mkks-202ENSMUST00000110089 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Gm43371-201ENSMUST00000202838 1031 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Ap3b2-205ENSMUST00000152355 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
AmbpQ07456 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 240.3 ms