Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm12105-201ENSMUST00000120846 779 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Vmn1r-ps146-201ENSMUST00000176131 525 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm28064-201ENSMUST00000185639 858 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Snhg14-204ENSMUST00000185890 756 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm37987-201ENSMUST00000194999 825 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Olfr1457-201ENSMUST00000075170 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Sel1l2-201ENSMUST00000120133 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm16243-201ENSMUST00000160351 494 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 1700109I08Rik-201ENSMUST00000185680 396 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm28466-201ENSMUST00000190678 659 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm6321-201ENSMUST00000194460 1090 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm44969-201ENSMUST00000207829 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm19137-201ENSMUST00000213790 1164 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Pah-204ENSMUST00000219813 789 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 D130040H23Rik-201ENSMUST00000078257 1218 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Lce1e-201ENSMUST00000090867 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Rfpl4-202ENSMUST00000179971 1445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Odam-202ENSMUST00000129757 1370 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm11245-201ENSMUST00000119419 1037 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm25179-201ENSMUST00000122632 128 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm4473-201ENSMUST00000145987 657 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Vmn1r238-201ENSMUST00000165255 921 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm43005-201ENSMUST00000199015 648 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm19170-201ENSMUST00000212440 1084 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Olfr1092-ps1-201ENSMUST00000216544 398 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 AC138027.1-201ENSMUST00000218324 472 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sox12Q04890 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms