Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 2610027F03Rik-202ENSMUST00000186982 603 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Eef1d-206ENSMUST00000109975 2842 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Gm45716-203ENSMUST00000153734 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Gm9081-201ENSMUST00000182346 991 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Gm18059-201ENSMUST00000208073 580 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 AC153891.1-201ENSMUST00000213761 742 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Gm15197-201ENSMUST00000120526 478 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Gm11417-201ENSMUST00000150536 920 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 4930555K19Rik-201ENSMUST00000060066 171 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nphp4P59240 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms