Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Bmp1-201ENSMUST00000022693 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 4933431M02Rik-201ENSMUST00000203905 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 AC025913.2-202ENSMUST00000219248 605 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Gm38292-201ENSMUST00000192646 3045 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Mfsd13b-201ENSMUST00000033166 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Rrp1P56183 D630008O14Rik-201ENSMUST00000144260 1568 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
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