Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Ms4a15-201ENSMUST00000087923 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Igf1-201ENSMUST00000062862 2292 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Wipf1-203ENSMUST00000102680 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Sh3bp1P55194 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms