Protein–RNA interactions for Protein: P54728

Rad23b, UV excision repair protein RAD23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23bP54728 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Pex5l-203ENSMUST00000108221 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Gm13981-201ENSMUST00000122360 447 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Gm12000-201ENSMUST00000132007 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Pigx-212ENSMUST00000215073 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Defa3-201ENSMUST00000098893 410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Fam71f1-201ENSMUST00000090487 1584 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Gm11981-201ENSMUST00000139769 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 2810049E08Rik-201ENSMUST00000185600 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Mpzl1-203ENSMUST00000191818 853 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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Rad23bP54728 Gm2448-201ENSMUST00000207080 559 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Zfp445-205ENSMUST00000214626 1220 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Apoa5-205ENSMUST00000215187 495 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 AC154759.1-201ENSMUST00000224137 1159 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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Rad23bP54728 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Gm14820-201ENSMUST00000126286 1449 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Gm20822-201ENSMUST00000165756 687 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Gm20828-201ENSMUST00000170889 687 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 1700017I07Rik-201ENSMUST00000184823 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Rad23bP54728 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
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