Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Rgs11-201ENSMUST00000025020 2006 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Cdh22-201ENSMUST00000065438 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Tgoln1-201ENSMUST00000070524 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 AC113082.1-201ENSMUST00000217324 327 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Ube2e3P52483 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms