Protein–RNA interactions for Protein: P50446

Krt6a, Keratin, type II cytoskeletal 6A, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6aP50446 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Nuak2-201ENSMUST00000072177 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Tuft1-201ENSMUST00000006123 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
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Krt6aP50446 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Parp14-201ENSMUST00000042665 7417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Slc26a2-202ENSMUST00000146409 7814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Dzip1l-202ENSMUST00000112884 3791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Krt6aP50446 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Krt6aP50446 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
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Krt6aP50446 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 B230317F23Rik-201ENSMUST00000052189 2472 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Cyb5rl-202ENSMUST00000106756 1604 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Krt6aP50446 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
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