Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Tenm2-208ENSMUST00000163524 8668 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Slco2a1-201ENSMUST00000035148 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Cacna1c-219ENSMUST00000189389 6603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Sell-201ENSMUST00000027871 2199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Cdc45-202ENSMUST00000096990 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm5419-201ENSMUST00000119301 527 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rab11bP46638 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms